恒达平台代表隊獲國際基因工程機器大賽2枚金牌,首獲Best Software獎項
來源🙂↕️:生命科學與技術學院
時間:2021-11-17 瀏覽📥🧛🏻♀️:
11月14日,國際基因工程機器大賽(International Genetically Engineered Machine Competition🥌,iGEM)2021全球總決賽落下帷幕📕。恒达平台代表隊斬獲兩枚金牌,並首次獲得Best Software獎項。這也是恒达平台參加iGEM賽事八年來取得的又一歷史性突破👨🏿🍼💐。
iGEM最初由美國麻省理工學院主辦,是合成生物學領域的頂級國際性學術賽事🦒,如今已經成功舉辦16屆📁🆎,旨在鍛煉學生的自主創新和團隊協作能力,同時培養其對科學的熱情✨。合成生物學是近年來生命科學領域的新興研究方向🚏,其目標是通過重組現有基因,構建對生命科學研究或者生產生活實踐具有價值的生物系統。iGEM競賽以合成生物學為基礎🤶🏽,更加關註設計生物系統對iGEM社區和社會的實際作用,要求學生自主選題,設計並構建生物系統並實現對該系統的操控👨💼,將其應用於社會中得到反饋加以調整,最終製作wiki網站🥠、視頻等進行展示並進行答辯。參賽學生可將研究所取得的成果提交給 iGEM Foundation,供全球的科學家共享,從而使學生的創新成果擁有更為深遠的學術價值和潛在應用價值。今年共有來自48個國家或地區的352支隊伍參賽,其中包括MIT🥢、Harvard🧑🏻🔧💳、Cambridge🗓🤾🏿、TUdelft、Heidelberg 🌐、ETH_Zruich等世界一流學府的代表隊,國內著名學府清華大學、北京大學、上海交通大學🏃➡️、復旦大學🦎、中國科技大學等也派隊參加,競爭十分激烈。
我校今年共派出由隊長趙艷萍、汪明傑、卓正一等學生組成的Tongji_Software和由隊長張藝瀛🌕、胡紅娟等學生組成的Tongji_China兩支代表隊參賽。隊員們來自生命科學與技術學院、醫學院🧑🏼🚒、軟件學院🤛🏿、設計創意學院☝🏿、數學科學學院🧩、電子與信息工程學院6個學院。在近一年的備賽過程中💁🏼♂️,隊員們進行了往期項目調研🕺✦、項目選題、軟件功能設計🧑🏻⚖️、實驗設計、人文實踐🍎、算法和建模設計,圓滿完成項目並在項目展示、問題回答環節表現突出🧑🏿🎓,獲得國際評委的高度認可與贊賞。
Tongji_Software參賽項目為噬菌體-微生物組學助力噬菌體療法(Phage-Microbiome Assist Phagotherapy, Phage-MAP)🎲。團隊成員在定題初期立足於解決醫療難題“超級細菌”🙋🏿♂️,並在之後的文獻查閱🦸🏼、社會調研中🤔🙅🏿,將焦點鎖定在耐藥菌的噬菌體療法👩🏽⚕️🕋。目前,這一療法已成為最有希望替代抗生素以用來治療耐藥菌的方法,但在實驗室做耐藥菌-噬菌體斑的篩查往往需要尋找樣本,培養宿主細菌🛴,謹慎考慮各類安全問題🍚,十分耗費人力物力。而與濕實驗相比,使用計算的方法去探究噬菌體-細菌的相互作用,則可以降低成本🪙、節省時間🧑🏼⚕️,更加高效且經濟。Tongji_Software基於微生物基因組中的k-mers組成🍑、CRISPR免疫系統等,構建了噬菌體-細菌相互作用網絡,以期為超級細菌的噬菌體療法提供參考。(詳情可見https://2021.igem.org/Team:Tongji_Software)
這是Tongji_Software代表隊第四年參賽。在前三年,該隊從alpha ant、path lab再到synthesis navigator,已收獲3枚金牌🍦。今年🏃♀️,在張敬、劉琦🧣、冷曄等教師指導和往屆隊員朱俊、姜文淵等建議下,來自5個學院的14名隊員團結協作👏🏼,最終獲得了iGEM 軟件賽道的全球best software獎項👩🏽⚖️。
秉持著 iGEM“Local people solve local problem (當地人解決當地問題)”的比賽精神,Tongji China今年的項目聚焦於解決上海市垃圾分類大背景下的廚余垃圾臭味問題🧑🏼🦲。通過文獻閱讀和深入社會、產業調研👨🏻,隊員們了解到廚余垃圾的臭味對民眾生活和相關產業的影響,而現有的除臭方式則存在著難以實現臭氣原位去除、除臭持續時間短🌥、成本較高等缺點。硫化氫是廚余垃圾臭氣的主要成分之一,隊員們成功構建了以大腸桿菌為底盤的硫化氫快速降解工程菌,將硫化氫轉化為對濕垃圾堆肥過程中有益的物質,構建的工程菌能在模擬廚余垃圾發酵過程中實現有效的硫化氫去除🧊。通過啟動子組合的優化,隊員們進一步提高了工程菌的硫化氫去除能力💚。此外🗾,隊員們還設計並構建了依賴於臭氣濃度調控的三檔自殺開關,以確保工程菌使用過程中的生物安全🧜🏽♀️🧏🏿♂️。(詳情可見https://2021.igem.org/Team:Tongji_China)
生命科學與技術學院相關負責人表示,此次獲獎是師生共同努力的結果,也是學院重視學科交叉,培養創新人才所取得的又一重大成果。為了能夠了解實際生產和理論研究的前沿🧛🏿♀️,隊員們在推進項目的同時,多次深入相關企業參訪,獲得第一手資料,並與國內外其他高校iGEM參賽隊開展交流,互通有無,還走進中小學將生命科學、合成生物學的理念帶入校園👨👨👧。